Directeur de recherches INRAE
UMR CARRTEL
Centre Alpin de Recherches sur les Réseaux Trophiques et les Écosystèmes Lacustres
Responsabilités scientifiques et administratives :
Depuis janv 2020 : Directeur de l'unité mixte de recherche CARRTEL (INRAE & Université Savoie Mont Blanc) https://www6.lyon-grenoble.inrae.fr/carrtel
De janv 2016 à janv 2019 : Chef de département adjoint EFPA INRA
De 2014 à 2020 : Animatrice scientifique du SOERE OLA http://www6.inra.fr/soere-ola
De 2009 à 2016 : Responsable scientifique du plateau Biologie Moléculaire (UMR CARRTEL)
De 2008 à 2015 : Responsable de l'Equipe BioFEEL (UMR CARRTEL)
leader WP 1 INTERREG Alpine Space EcoAlpsWater https://www.alpine-space.eu/projects/eco-alpswater/en/home
Parcours professionnel :
- Depuis 2013 : Dir. de Recherche INRAE
- De 2009 à 2013 : Chargé Recherche INRAE
- De 2000 à 2009 : Maitre de Conférences Université de Savoie
Formation :
- 2010 HDR Biodiversité Univ de Savoie
-1999 Doctorat Biologie des Populations et Écologie, Univ. Blaise Pascal (Clermont Fd)
-1996 DEA Biologie option Protistologie, Univ. Blaise Pascal (Clermont Fd)
Appoches et outils :
Approches écosystèmiques et expérimentales (microcosmes, mésocosmes),
Limnologie et Paléolimnologie
Approches moléculaires : séquençage massif & metabarcoding, qPCR, ddPCR, ADN environnemental & ADN ancien
Thématiques Recherche
Diversité, structure, fonctionnement des réseaux trophiques microbiens lacustres :
Mes travaux de recherche relèvent de l’écologie fonctionnelle appliquée au milieu lacustre, l’objectif général étant d’identifier les liens existants entre l’organisation des communautés planctoniques et le fonctionnement des écosystèmes lacustres.
Les questions abordées concernent l’étude
(i) de la diversité (actuelle et passée) des communautés microbiennes planctoniques
(ii) des interactions trophiques s'établissant entre les communautés microbiennes et des transferts trophiques vers les réseaux supérieurs
(iii) des facteurs de régulation qui affectent la dynamique, la structure, la diversité et l'activité des micro-organismes planctoniques. lacustre.
Résultats récents
Le potentiel de l'ADN sédimentaire pour retracer la diversité passée : focus sur les eucaryotes unicellulaires et leur dynamique temporelle à long terme (Capo et al 2015, 2016, 2017ab, 2019; Domaizon et al 2017; Keck et al 2020 ; Capo et al 2022; Gauthier et al 2022; Barouillet et al 2022)
La diversité des cyanobactéries reconstruite à partir des archives sédimentaires : Couplage entre outils moléculaires et paléolimnologie (Savichtcheva et al 2011; Domaizon et al 2013 ; Savichtcheva et al 2014 ; Monchamp et al 2018).
Application du séquençage massif pour le décryptage de la diversité du plancton eucaryote (Mangot et al, 2013; Lepère et al 2013; Deboras et al 2015, 2017; Lepère et al 2016 ; Debroas et al 2017 ; Lepère et al 2019 ; Metz et al 2019; Vasselon et al 2019; Canino et al 2021).
Scienitists' Warning to humanity : Les scientifiques alertent sur le devenir des grands lacs soumis aux pressions locales et globales (Jenny et al 2020)
L'observatoire OLA
L'observatoire des Lacs regroupe 9 laboratoires de recherche
L’ambition du SOERE OLA est d’observer, comprendre et modéliser l’évolution de l’état et des fonctionnements écologiques d’écosystèmes lacustres dans un contexte de changements environnementaux (locaux et globaux).
Les données historiques d'OLA : 60 ans de données limnologiques accessibles (Rimet et al 2020).
Laboratoire d'accueil UMR CARRTEL : http://www7.dijon.inra.fr/thonon
Département INRA (EFPA) : http://www.efpa.inra.fr/
Isabelle Domaizon