Lepère Cécile (2006)  Diversité, dynamique et facteurs de régulation des picoeucaryotes dans les écosystèmes lacustres.
Co-encadrement: Pr D. Debroas (LMGE Univ. Blaise Pascal)

 

Personnic Sébastien (2006) Dynamique des communautés microbiennes et impacts des virus sur les bactéries auto- et hétérotrophes en milieu lacustre. Co encadrement: S Jacquet  (CARRTEL)

 

Berdjeb Lyria (2010) Les communautés bactériennes des lacs d’Annecy et du Bourget : Dynamique, Structure et principaux facteurs de régulation. Co-encadrement: S. Jacquet (UMR CARRTEL)

 

Mangot Jean Francois (2011) Dynamique spatio-temporelle du picoplancton eucaryote lacustre : approches moléculaires par FISH et Pyroséquençage. Co-encadrement: Pr D. Debroas (LMGE Univ. Blaise Pascal)

 

Sotton Benoit (2012)Effet des blooms à cyanobactéries sur les communautés piscicoles lacustres.  Co-encadrement: O. Anneville et J. Guillard (UMR CARRTEL – INRA)

 

Billard Elodie (2015) Etude des communautés microbiennes fonctionnelles benthques impliquées dans le cycle du méthane  Co-encadrement: E. Lyauthey (MC- UMR CARRTEL-Univ.Savoie)

 

Capo Eric (2016) Dynamique temporelle des communautés microbiennes eucaryotes en lien avec les forçages climatiques et anthropiques : Approche paléolimnologique basée sur le séquençage massif d'ADN sédimentaire  Co-encadrement: F Arnaud (CR1- UMR EDYTEM- CNRS/Univ.Savoie)

 

Vasselon Valentin (2017) Barcoding et bioindication : développement du metabarcoding des diatomées pour l'évaluation de la qualité des cours d'eau   Co-encadrement: A Bouchez (UMR CARRTEL – INRA)

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Hervé Alix (2023)  Standardisation d’une méthode de suivi de la faune piscicole en écosystèmes lentiques par l’ADN environnemental  Co-encadrement: M Logez (Recover INRAE) & T Dejean (Spygen)

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Rotschi Julie - Rôle de la productivité primaire dans le contrôle de la séquestration de carbone par les lacs aux échelles régionales et globale durant l’Anthropocène : couplage des approches paléolimnologiques, éco-génomiques et pigmentaires   Co-encadrement: JP Jenny  (Carrtel INRAE) & I Gregory Eaves (Mc Gill Univ CA)

 

Lacombe Marc (en cours)  Réponses des communautés microbiennes aux changements environnementaux : approche paleomicrobiologique en lacs. Co-encadrement: D Etienne & E Lyautey (USMB Carrtel)

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Gauvin Paula (en cours) Capteurs d'ADN environnemental : mesurer la biodiversité dans les milieux renaturés Co-encadrement: F Rimet